Hej tamo! Kao dobavljač Fmoc - His - Aib - OH TFA, često me pitaju o mogućim nuspojavama ovog jedinjenja. Pa, mislio sam da napišem ovaj blog kako bih podijelio neke uvide o tome.
Prvo, hajde da brzo shvatimo šta je Fmoc - His - Aib - OH TFA. Fmoc je skraćenica za fluorenilmetiloksikarbonil, koja je uobičajena zaštitna grupa u sintezi peptida. Njegov je histidin, esencijalna aminokiselina. Aib je α - aminoizobuterna kiselina, ne-proteinogena aminokiselina koja može dati jedinstvena strukturna svojstva peptidima. A TFA je trifluorosirćetna kiselina, koja se često koristi u koracima deprotekcije u sintezi peptida.
Bočne reakcije vezane za uklanjanje zaštite
Jedan od najčešćih scenarija u kojem se mogu pojaviti nuspojave je tokom uklanjanja zaštite Fmoc grupe. Fmoc grupa se obično uklanja upotrebom baze, obično piperidina. Međutim, pod određenim uslovima mogu se javiti neke neželjene reakcije.
Histidine Modification
Histidin ima imidazolni bočni lanac, koji je relativno reaktivan. Tokom osnovnog uklanjanja zaštite sa Fmoc grupe, postoji rizik da histidin bude alkiliran ili na drugi način modifikovan. Osnovno okruženje može uzrokovati reakciju imidazolnog dušika s nečistoćama ili drugim reaktivnim vrstama u reakcijskoj smjesi. Na primjer, ako su prisutne količine alkil halida u tragovima, histidinski bočni lanac može proći reakciju alkilacije, što dovodi do modificiranog proizvoda.
Aib - povezane reakcije
α - aminoizobuterna kiselina (Aib) je malo posebna zbog svojih glomaznih metil grupa. Ove metilne grupe ponekad mogu uzrokovati sterične smetnje tokom procesa uklanjanja zaštite. U nekim slučajevima, baza možda neće moći tako lako pristupiti Fmoc grupi, što dovodi do nepotpunog uklanjanja zaštite. A ako su uvjeti reakcije preteški da bi prisilili uklanjanje zaštite, to može uzrokovati druge sporedne reakcije, kao što je racemizacija Aib ostatka. Racemizacija znači da se kiralni centar Aib amino kiseline može invertirati, što rezultira mješavinom različitih stereoizomera.
Coupling Reactions
Kada se Fmoc - His - Aib - OH TFA koristi u sintezi peptida, provode se reakcije spajanja kako bi se on povezao s drugim aminokiselinama. Ove reakcije spajanja obično su posredovane sredstvima za spajanje kao što je HBTU (O - benzotriazol - N,N,N',N' - tetrametil - uronijum - heksafluor - fosfat) ili DIC (N,N' - diizopropilkarbodiimid).
Histidin Side - Lanac Interference
Histidinski bočni lanac može ometati reakciju spajanja. Imidazolna grupa može djelovati kao nukleofil i reagirati sa sredstvom za spajanje ili aktiviranom amino kiselinom. To može dovesti do stvaranja nusproizvoda, kao što je histidin - adukti sredstva za spajanje. Ovi adukti mogu dalje reagirati na neočekivane načine, što dovodi do složene mješavine proizvoda.
Aib Steric Effects
Kao što je ranije spomenuto, sterički dio Aib-a također može utjecati na reakcije spajanja. Krupne metil grupe mogu otežati agensu za spajanje da se približi karboksilnoj grupi Aib i formira aktivirani ester. To može rezultirati manjim prinosima spajanja i dužim vremenom reakcije. A ako je reakcija prisiljena da se završi povećanjem vremena reakcije ili količine sredstva za spajanje, to može povećati rizik od nuspojava, kao što je stvaranje diketopiperazina. Diketopiperazini su ciklični dipeptidi koji se mogu formirati kada amino i karboksilne grupe dvije susjedne aminokiseline reaguju intramolekularno.
Bočne reakcije povezane s kiselinom
Budući da je TFA često uključen u proces sinteze, nuspojave povezane s kiselinom također su zabrinjavajuće.
TFA - posredovano cijepanje
TFA se koristi za konačno uklanjanje zaštitnih grupa bočnih lanaca u sintezi peptida. Međutim, može izazvati i neke neželjene reakcije cijepanja. Na primjer, ako su uvjeti reakcije previše kiseli ili je vrijeme reakcije predugo, TFA može rascijepiti peptidnu vezu između Hisa i Aib. To može dovesti do stvaranja kraćih peptidnih fragmenata i smanjenja ukupnog prinosa željenog proizvoda.
Histidin Protonation
Imidazolna grupa histidina može biti protonirana pomoću TFA. Iako je ovo obično reverzibilan proces, u nekim slučajevima, protonirani histidin može reagirati s drugim vrstama u reakcijskoj smjesi. Na primjer, može reagirati s vodom ili drugim nukleofilima prisutnim u otopini, što dovodi do stvaranja modificiranih derivata histidina.
Kako minimizirati bočne reakcije
Da bi se ove nuspojave svele na minimum, važno je pažljivo kontrolisati uslove reakcije. Za uklanjanje zaštite Fmoc grupe, ključna je upotreba prave koncentracije baze i odgovarajućeg vremena reakcije. Također je dobra ideja pročistiti reagense i otapala kako bi se smanjilo prisustvo nečistoća koje mogu uzrokovati nuspojave.
Kada su u pitanju reakcije spajanja, odabir pravog sredstva za spajanje i optimizacija uvjeta reakcije može pomoći. Na primjer, korištenje sredstva za spajanje koje je selektivnije i manje reaktivno prema histidinskom bočnom lancu može smanjiti stvaranje nusproizvoda. A za korake posredovane TFA, kontrola koncentracije kiseline i vremena reakcije može spriječiti neželjene reakcije cijepanja.
Related Compounds
Ako radite na sintezi peptida, možda će vas zanimati i neka srodna jedinjenja. na primjer,Fmoc - Thr(tBu) - Phe - OHje još jedan važan intermedijer u sintezi peptida. Ima drugačiju kombinaciju aminokiselina i zaštitnih grupa, koje mogu ponuditi različita svojstva i reaktivnost u odnosu na Fmoc - His - Aib - OH TFA.
Još jedno srodno jedinjenje jeBoc - His(Trt) - Aib - OH. Boc grupa je još jedna uobičajena zaštitna grupa, a Trt (tritil) grupa se koristi za zaštitu bočnog lanca histidina. Ovo jedinjenje se može koristiti u različitim sintetičkim strategijama gdje je Boc grupa poželjnija u odnosu na Fmoc grupu.
IBoc - His(Trt) - Aib - Glu(OtBu) - Gly - OHje složeniji peptidni intermedijer. Sadrži više aminokiselina i zaštitnih grupa, koje se mogu koristiti u sintezi dužih i složenijih peptida.
Zaključak
U zaključku, Fmoc - His - Aib - OH TFA je koristan spoj u sintezi peptida, ali dolazi sa vlastitim skupom potencijalnih nuspojava - reakcija. Razumijevanje ovih nuspojava i kako ih minimizirati je ključno za dobivanje visokokvalitetnih peptida.
Ako ste uključeni u sintezu peptida i zainteresirani ste za kupovinu Fmoc - His - Aib - OH TFA ili bilo kojeg od srodnih spojeva koje sam spomenuo, slobodno se obratite za raspravu o nabavci. Možemo razgovarati o količinama koje su vam potrebne, zahtjevima kvaliteta i najboljim cijenama.
Reference
- Chan, WC, & White, PD (2000). Fmoc Solid Phase Peptide Synthesis: A Practical Approach. Oxford University Press.
- Fields, GB, & Noble, RL (1990). Sinteza peptida u čvrstoj fazi korištenjem 9 - fluorenilmetoksikarbonil aminokiselina. International Journal of Peptide and Protein Research, 35(2), 161 - 214.